显微镜是在1590年由荷兰的詹森父子所首创。显微镜的类型有许多。最常见的(和第一个被发明的)是光学显微镜，其使用样品的光图像。其他主要的显微镜类型是电子显微镜(透射电子显微镜、X光显微镜、扫描电子显微镜)、超显微镜，和各种类型的扫描探针显微镜。

1953年，弗里茨·塞尔尼克因为对相衬法的证实，发明相衬显微镜获得诺贝尔物理学奖。

1986年，恩斯特·鲁斯卡因研制第一台透视电子显微镜获得诺贝尔物理学奖。格尔德·宾宁、海因里希·罗雷尔因研制扫描隧道显微镜获得诺贝尔物理学奖

2014年10月8日，诺贝尔化学奖颁给了艾力克·贝齐格 (Eric Betzig)，W·E·莫尔纳尔 (William Moerner)和斯特凡·W·赫尔 (Stefan Hell)，奖励其发展超分辨荧光显微镜 (Super-Resolved Fluorescence Microscopy)，带领光学显微镜进入纳米级尺度中。

2017年，雅克·杜博歇、约阿希姆·弗兰克、理查德·亨德森因研制用于溶液内生物分子的高分辨率结构测定的低温电子显微镜获得诺贝尔化学奖。

1、目镜：放大物像，有5X，10X，40X等等。

2、镜筒：连接目镜与物镜。

3、转换器：物镜的连接处，用来转换物镜。

4、物镜：放大物像，一般有三个，放大倍数一般是4X，10X，40X。

5、载物台：放置玻片标本，上面还有压片夹。

6、通光孔：通过光线。

7、遮光器：调节光线强弱。

8、压片夹：固定玻片标本。

9、粗准焦螺旋：调焦距，用低倍镜观看的时候用，高倍镜不能使用。

10、反光镜：使光线射入镜筒(现在显微镜一般都没有这个结构了，都是有电源的，比较方便)。

11、细准焦螺旋：调焦距，使用高倍镜观察的时候使用。

12、镜臂：连接镜座与镜身的，提握镜身，使用时一般右手握镜臂。

13、镜柱：支持镜身。

显微镜以显微原理进行分类可分为偏光显微镜、光学显微镜与电子显微镜和数码显微镜。

1、光学显微镜：通常皆由光学部分、照明部分和机械部分组成。无疑光学部分是最为关键的，它由目镜和物镜组成。光学显微镜的种类很多，主要有明视野显微镜(普通光学显微镜)、暗视野显微镜、荧光显微镜、相差显微镜、激光扫描共聚焦显微镜、偏光显微镜、微分干涉差显微镜、倒置显微镜。

2、电子显微镜：电子显微镜比光学显微镜高得多的对物体的放大及分辨本领，它将电子流作为一种新的光源，使物体成像。电子显微镜种类包括透射电子显微镜、X光显微镜、扫描电子显微镜。常用于生物、医药及微小粒子的观测。

3、偏光显微镜：凡具有双折射的物质，在偏光显微镜下就能分辨的清楚，当然这些物质也可用染色法来进行观察，但有些则不可用，而必须利用偏光显微镜。偏光显微镜主要是用是来观察液晶、纤维等自身具有单折射性或双折性的物体。

4、数码显微镜：数码显微镜是将精锐的光学显微镜技术、先进的光电转换技术、液晶屏幕技术完美地结合在一起而开发研制成功的一项高科技产品。从而，我们可以对微观领域的研究从传统的普通的双眼观察到通过显示器上再现，从而提高了工作效率。